Kalın bağırsak kanseri taramasında altın standart olan kolonoskopi; polip tespiti ve çıkarılması, inflamatuvar bağırsak hastalıkları tanısı ve rektal kanama araştırmasında kullanılan, kolorektal kanseri erken evrede saptamaya yönelik temel bir endoskopik yöntemdir.
Safra taşı ekstraksiyonu, biliyer stent yerleştirme ve pankreas kanalı tedavisinde kullanılan ERCP; floroskopi eşliğinde endoskopik olarak gerçekleştirilen, cerrahi gerektirmeyen etkili bir biliyer-pankreatik sistem girişim yöntemidir.
Mide, özofagus ve duodenum hastalıklarının tanı ve tedavisinde kullanılan üst GIS endoskopi (gastroskopi); biyopsi alma, H. pylori tespiti, Barrett özofagusu izlemi ve erken tümör tanısını mümkün kılan temel bir endoskopik değerlendirme işlemidir.